Dados do Trabalho

Título

Análises in silico e prospecção de sequências mitocondriais de referência para identificação molecular de primatas do Brasil

Corpo do texto

Os métodos de DNA barcoding e metabarcoding baseiam-se nas variações de regiões específicas do DNA mitocondrial (mtDNA) para diferenciar espécies, sendo úteis em análises forenses e em estudos de incertezas taxonômicas e de DNA ambiental. Apesar de sua eficiência, o uso de DNA barcoding pode se constituir um desafio para alguns táxons devido à ausência de sequências de referências públicas e/ou inconsistências nos dados disponíveis. Para as 130 espécies de primatas do Brasil, o emprego desses métodos pode ser ainda mais desafiador, visto que a região informativa do mtDNA pode variar, gerando vieses nas análises comparativas entre táxons. Considerando esse contexto, o presente trabalho visou realizar uma análise comparativa entre sequências barcode de 105 espécies pertencentes a todos os 17 gêneros de primatas ocorrentes no Brasil. Para isso, foi realizada uma análise in silico na principal base mundial de dados públicos de DNA (GenBank), para o levantamento de sequências mitocondriais dos três principais genes utilizados como barcode: Citocromo Oxidase I (COI), Citocromo B (Cytb) e 16S RNA ribossômico (16SrRNA). Além disso, um conjunto inédito de 16 sequências foi produzido para 11 espécies de primatas que não tinham dados disponíveis. A busca no GenBank evidenciou sequências dos genes Cytb, COI e 16SrRNA, respectivamente, para 96, 81 e 74 espécies de primatas brasileiros. O alinhamento das sequências e a análise de dissimilaridade dentro de cada gênero mostrou que o gene Cytb é resolutivo para diferenciar espécies congêneres em apenas quatro gêneros. Já o gene COI se mostrou o mais resolutivo para diferenciar as espécies do gênero [Alouatta]. Para os outros 12 gêneros analisados, nenhum marcador foi suficientemente resolutivo para separar espécies congêneres. Estes resultados indicam a necessidade de produção de novas sequências de referências para primatas brasileiros, visando identificar barcodes eficientes e assim otimizar os estudos baseados em DNA barcoding e metabarcoding.

Financiadores

Conselho Nacional de Desenvolvimento Científico e Tecnológico (CNPq, 317345/2021-4; 130862/2022-3); Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado de São Paulo (FAPESP, 17/23548-2)

Palavras-chave

Genética da conservação; delimitação de espécies; Platyrrhini