Dados do Trabalho

Título

Caracterização Genética de Amostras do Gênero Callicebus Utilizando Marcadores Genômicos

Corpo do texto

O gênero Callicebus é endêmico do Brasil, com cinco táxons reconhecidos: Callicebus personatus Geoffroy 1812 (Cp), Callicebus melanochir Wied Neuwied 1820 (Cm), Callicebus nigrifrons Spix 1823 (Cn), Callicebus barbarabrownae Hershkovitz 1990 (Cb) e Callicebus coimbrai Kobayashi and Langguth 1999 (Cc). Existem divergências sobre a classificação taxonômica destas formas e seu nível enquanto espécies ou subespécies. Na primeira etapa do presente estudo, investigamos a filogenia das formas de Callicebus, ampliando o número de indivíduos amostrados e incluindo animais de vida livre e todas as espécies, procurando maior robustez na reconstrução histórico-evolutiva do gênero. Geramos uma matriz de dados com 483.532 SNPs (com 75% de completude), utilizada nas análises filogenéticas. Na reconstrução, a árvore filogenética indicou que, dentro do gênero, a espécie Cn foi a primeira a divergir, seguida por Cp, e Cm, tendo como últimas divergências Cb e Cc. Entretanto, as duas últimas espécies foram reconstruídas como parafiléticas. A caracterização da estrutura e diversidade genética dos indivíduos e agrupamentos, utilizando genômica populacional, permitiu inferir hibridação. A matriz reduzida de SNPs (mantivemos aqueles >=5.000 pb de distância - software VCFTOOLS; retiramos aqueles sob potencial pressão seletiva - BayeScan), representou ca. 8.7% (42.052 SNPs). Com análises de genômica populacional (agrupamento Bayesiano, software STRUCTURE), inferiu-se o número ideal de populações. Para tanto, realizamos estimativas iniciais do valor de lambda (λ), com 10 repetições/valor de K (variando de acordo com cada análise posterior). Usamos a média dos valores nas análises subsequentes através do modelo ADMIXTURE (considera a frequência de alelos correlacionada entre diferentes espécies/populações) e avaliamos o K (de 1–10), com 10 repetições para cada K, com  150.000 iterações de burn-in seguidas por  250.000 iterações. Identificamos K=3 como o número mais provável de clusters (delta K - ΔK; CLUMPAK). A caracterização genético-populacional das atuais amostras não dão suporte à divisão em cinco espécies, corroborando a filogenia acima. Assim, os resultados sugerem que Cb e Cc pertencem a um único agrupamento taxonômico, indicando dúvida sobre a identificação dessas espécies.     

Financiadores

Financiamentos: RB-M (UFS/PNPD/CAPES: 88887.320996/2019-00) AMB (National Science Foundation) LT( Bolsa PIBIC ICMBio)

Palavras-chave

Palavras-chave: Filogenia, filogenômica, Guigós, Primatas neotropicais, genética da conservação.